Informācija par budžeta izdevumiem un nodarbināto skaitu tiek publicēta atbilstoši Ministru prezidenta V.Dombrovska 2009. gada 30. jūlija rezolūcijai Nr.111-1/99.
Zāļu valsts aģentūra nesaņem finansējumu no valsts budžeta, jo savu darbību pilnībā nodrošina no pašu ieņēmumiem, kas gūti, sniedzot maksas pakalpojumus.